More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2992 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2992  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 356 aa  725    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.147327  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0614  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.97 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0278686  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1214  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.25 
 
 		 351 aa  481  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2711  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.75 
 
 		 356 aa  448  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.46 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.68 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  57.79 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  57.79 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.11 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.26 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.79 
 
 		 367 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  58.61 
 
 		 359 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  58.76 
 
 		 352 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.08 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.47 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.4 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.98 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.66 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.17 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  60.51 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.14 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.51 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.74 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.94 
 
 		 351 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.54 
 
 		 355 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.74 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.76 
 
 		 353 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1571  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.71 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.54 
 
 		 355 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.54 
 
 		 355 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5836  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.51 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.54 
 
 		 355 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.51 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.6 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  58.89 
 
 		 359 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.78 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  57.91 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.89 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.1 
 
 		 365 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.01 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.19 
 
 		 352 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.65 
 
 		 367 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.76 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  0.462988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0837  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.99 
 
 		 361 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5396  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.21 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  58.54 
 
 		 356 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.97 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.04 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2132  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.89 
 
 		 363 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4003  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.76 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2670  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.76 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3691  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.76 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.139305  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  60.12 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.26 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.83 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  57.02 
 
 		 371 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1192  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.53 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.428891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.83 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.92 
 
 		 360 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0701  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.26 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.004629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  57.26 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.52 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.36 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.46 
 
 		 353 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.86 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2352  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.31 
 
 		 352 aa  421  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.82 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4006  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.24 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  57.78 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  60.12 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.17 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1616  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.53 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945868  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.86 
 
 		 356 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.86 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.41 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2900  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.99 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  57.42 
 
 		 365 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.55 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.53 
 
 		 361 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.55 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.55 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.57 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3188  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.08 
 
 		 375 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.02 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.55 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.11 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0165  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.66 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.183737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.6 
 
 		 360 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4078  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.43 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29374  normal  0.0761668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2379  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577133  hitchhiker  0.00102073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.1 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1071  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2859  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.38 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0536365  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0544  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.76 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.32 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.86 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2242  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.91 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.9 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3844  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.74 
 
 		 346 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919278  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.61 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>