More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0908 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
314 aa  616  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44 
 
 
309 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 
292 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
279 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.56 
 
 
292 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
296 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
296 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
279 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  27.24 
 
 
299 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
292 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  27.11 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
309 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
302 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
298 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  27.48 
 
 
299 aa  89  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  27.18 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  33.88 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.06 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  30.39 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.76 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  35.43 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  29.38 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  30.11 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  29.55 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  32.71 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
277 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
324 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
372 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
368 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  32.95 
 
 
329 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
341 aa  62.4  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  27.41 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.53 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.03 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  28.75 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  32.6 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  28.81 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  30.57 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.9 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  26.14 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  31.25 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
506 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>