More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0914 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
295 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.37 
 
 
290 aa  355  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  62.98 
 
 
292 aa  345  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.63 
 
 
290 aa  338  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.67 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.14 
 
 
279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.66 
 
 
292 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.33 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.33 
 
 
296 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.34 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 
301 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 
297 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  38.59 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 
302 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
282 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  36.54 
 
 
297 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
302 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
321 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  30.39 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
300 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  31.1 
 
 
293 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
322 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
315 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
309 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  31.31 
 
 
313 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  30.13 
 
 
295 aa  99  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  29.51 
 
 
299 aa  99  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
314 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
560 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  29.41 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  30.6 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  29.35 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  27.37 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  28.36 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  25.52 
 
 
340 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  30.94 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  32.28 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
510 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  25.52 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  25.52 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  25.52 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  25.52 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  25.52 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
252 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  30.94 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  25.52 
 
 
340 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  31.69 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
328 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  26.46 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.850459  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  25.93 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 
346 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
313 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  30.81 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5384  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.04 
 
 
341 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  23.12 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
261 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  24.39 
 
 
332 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  22.87 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  26.06 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>