More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4249 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
301 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.21 
 
 
302 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.65 
 
 
297 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.97 
 
 
297 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.05 
 
 
297 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  65.1 
 
 
299 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.33 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  62.24 
 
 
297 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.68 
 
 
299 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.72 
 
 
296 aa  332  5e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.02 
 
 
305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.23 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.23 
 
 
292 aa  209  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
282 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.86 
 
 
290 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
290 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.61 
 
 
292 aa  168  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
292 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
296 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  31.05 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  31.8 
 
 
293 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
322 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
302 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
321 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
309 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 
279 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  26.12 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
312 aa  89.4  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
308 aa  87  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
314 aa  85.9  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  30.81 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  30.81 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  31.35 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  29.63 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  29.23 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  25.08 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.24 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
560 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
283 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  29.9 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  24.85 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  26.61 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  25.79 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  29.84 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  29.32 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  29.84 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  25.8 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.99 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  24.71 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10113  GDP-mannose 4,6-dehydratase gca  26.46 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  29.23 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  25.23 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  28.11 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>