More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0472 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.48 
 
 
296 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.33 
 
 
300 aa  266  4e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 
312 aa  165  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 
302 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  30.74 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 
295 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.69 
 
 
282 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
299 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  32.06 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
302 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  30.24 
 
 
297 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.62 
 
 
292 aa  129  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
279 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
296 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 
290 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
327 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
322 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  31.44 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
298 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
315 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
295 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  28.99 
 
 
280 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.84 
 
 
318 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.4 
 
 
295 aa  85.9  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  28.72 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  29.43 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  29.87 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  27.81 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.53 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  27.38 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  27.99 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  29.94 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  25.8 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1784  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  29.79 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0823224  hitchhiker  0.00455237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.63 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  27.24 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  33.91 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  30.9 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2801  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  29.26 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000487358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0351  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  24.48 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  28.43 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  25.63 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  23.64 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>