More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4411 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44 
 
 
314 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.64 
 
 
279 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 
282 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
295 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.42 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  32.18 
 
 
299 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
303 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
290 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  30.69 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
297 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  29.14 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  30.13 
 
 
295 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
297 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
296 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
301 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  30.03 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
290 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  35.57 
 
 
293 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  34.45 
 
 
313 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
302 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
321 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
327 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  32.81 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  31.55 
 
 
280 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  31.55 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  32.26 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.27 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  33.53 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  32.97 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  31.49 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  32.42 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.23 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  30.77 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  34.46 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  32.24 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  32.95 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>