More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2418 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.88 
 
 
300 aa  322  6e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.48 
 
 
309 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 
312 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 
302 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.68 
 
 
282 aa  175  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
305 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.89 
 
 
279 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.85 
 
 
292 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  35.35 
 
 
299 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  35.55 
 
 
297 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 
290 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 
292 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
299 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
290 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
295 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 
292 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
302 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
301 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 
297 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  34.44 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
327 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
297 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
297 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.1 
 
 
321 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
314 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  30.41 
 
 
313 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
303 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
333 aa  85.9  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
334 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  26.94 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.45 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  34.27 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  34.1 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  28.43 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  33.53 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.2 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  33.14 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  31.12 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  32.95 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  34.25 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  28.43 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  27.13 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
285 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.42 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
317 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  26.35 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  27.44 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  33.15 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  29.03 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  28.25 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  30.52 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10113  GDP-mannose 4,6-dehydratase gca  31.8 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  26.03 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  32.6 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.409564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  25.47 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  29.75 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.047646  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  29.89 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  30.86 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>