More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3138 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  640    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.87 
 
 
322 aa  531  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  55.15 
 
 
293 aa  321  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.36 
 
 
327 aa  288  7e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  51.34 
 
 
313 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.26 
 
 
315 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.33 
 
 
292 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
302 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
279 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
296 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
292 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
299 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  32.7 
 
 
299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
297 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.1 
 
 
296 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
295 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
300 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 
305 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
298 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
302 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
297 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  28.66 
 
 
297 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
282 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
309 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  30.97 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  26.87 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  33.15 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  33.7 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  35.36 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1614  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  30.85 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  34.44 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  32.42 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  32.96 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1431  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  30.73 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  28.08 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4508  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  28.86 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575287  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  31.49 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  27.06 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  36.61 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  26.19 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  32.6 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  24.93 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  27.55 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  32.02 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  23.96 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1602  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  30.35 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  31.49 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  32.95 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  29.31 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  31.76 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  27.03 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  23.67 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  33.73 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  34.5 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  29.83 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  28.32 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  33.15 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  29.31 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  29.21 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  29.89 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.92 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  28.74 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  31.45 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  30.64 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  28.8 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  32.73 
 
 
308 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  24.28 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>