More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2865 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
305 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.66 
 
 
299 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.02 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.01 
 
 
302 aa  315  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.02 
 
 
297 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.85 
 
 
297 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
298 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.02 
 
 
297 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  49.32 
 
 
299 aa  291  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  49.66 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.64 
 
 
296 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.5 
 
 
279 aa  222  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.58 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.12 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 
282 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.76 
 
 
292 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 
292 aa  188  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 
302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
295 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 
290 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
296 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 
321 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
322 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
279 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
327 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  30.45 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  31.43 
 
 
313 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  23.99 
 
 
280 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
292 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  28.25 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2222  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.39 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  26.02 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  27.76 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.43 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
313 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  27.03 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 
560 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  29.08 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.97 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.46 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  33.53 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  27.86 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  28.02 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  30.1 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  27.65 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.78 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  28.95 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.37 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  28.95 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.77 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  33.54 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.33 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  26.41 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  25.59 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  28.42 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.21 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.81 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  36.21 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>