More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2573 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
312 aa  618  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.73 
 
 
300 aa  227  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 
296 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.08 
 
 
309 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.8 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
299 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
279 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.34 
 
 
282 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  37.13 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.97 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
292 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.02 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  30.25 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
321 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
290 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
292 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
301 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
322 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
302 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
297 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
279 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
298 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
297 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  33.33 
 
 
313 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
295 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  33.62 
 
 
297 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
315 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
299 aa  87  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.25 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  31 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.95 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.77 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  26.8 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  27.78 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  27.68 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.28 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  35.26 
 
 
321 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  33.14 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.08 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  34.09 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  34.68 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.33 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  30.51 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04727  UDP-glucose 4-epimerase (Eurofung)  33.13 
 
 
371 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  27.15 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  35.06 
 
 
329 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0476  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  25 
 
 
317 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0351  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  31.82 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
328 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  27.44 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  32.57 
 
 
332 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 
285 aa  63.5  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  34.68 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  29.31 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  29.31 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 
406 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  30.68 
 
 
333 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  29.55 
 
 
331 aa  62.8  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  31.21 
 
 
334 aa  62.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  28.65 
 
 
332 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  31.05 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>