More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0351 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0351  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
313 aa  630  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0634  dTDP-glucose 4,6-dehydratase related protein  33.87 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
306 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185672  normal  0.626445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
295 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
343 aa  122  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
335 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  30.51 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.31 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
328 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
343 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
317 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
319 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
322 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
327 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
318 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.22 
 
 
330 aa  106  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
318 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.36 
 
 
334 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
324 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
335 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
315 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
330 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2118  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
336 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
313 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  26.15 
 
 
326 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
316 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
369 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34177  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
347 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
317 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
360 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
316 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
325 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
326 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
346 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
329 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
329 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
325 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
321 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
353 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
302 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
315 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
323 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.15102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.6 
 
 
336 aa  102  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
325 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5384  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.38 
 
 
341 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
324 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
336 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  26.14 
 
 
321 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
343 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
333 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
337 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
349 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
337 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
331 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  27.81 
 
 
312 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
334 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
330 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  26.52 
 
 
326 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
324 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  25.64 
 
 
336 aa  99.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2948  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 
357 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.52 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
336 aa  99.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1622  UDP-glucose 4-epimerase  28.11 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
335 aa  99  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.55 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.88 
 
 
362 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000493434  normal  0.801041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
318 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
311 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.02 
 
 
342 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.19 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  26.82 
 
 
339 aa  97.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.44 
 
 
348 aa  97.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  27.3 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
342 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>