More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2948 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2948  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
318 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.35 
 
 
317 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.21 
 
 
346 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.89 
 
 
346 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.72 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.59 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.08 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 
365 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561113  normal  0.0105388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 
322 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.84 
 
 
356 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.37 
 
 
308 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.35 
 
 
314 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 
308 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.23 
 
 
349 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.23 
 
 
349 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.74 
 
 
348 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.74 
 
 
348 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.74 
 
 
348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.0540302 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.3 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.56 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.98 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.77 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.13 
 
 
319 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.18 
 
 
311 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  45.08 
 
 
340 aa  273  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  45.08 
 
 
340 aa  273  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.84 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.84 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 
346 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.28 
 
 
340 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.28 
 
 
340 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.98 
 
 
310 aa  271  7e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.42 
 
 
348 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115759  hitchhiker  0.00412284 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.62 
 
 
313 aa  270  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 
330 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 
319 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  45.4 
 
 
326 aa  269  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.31 
 
 
320 aa  269  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 
314 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 
317 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.45 
 
 
348 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.3 
 
 
322 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.39 
 
 
318 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3245  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.44 
 
 
331 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.73 
 
 
309 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.25 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.25 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.62 
 
 
316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 
347 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  43.87 
 
 
514 aa  265  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 
317 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.11 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
318 aa  265  7e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 
313 aa  264  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.89 
 
 
333 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.38 
 
 
341 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 
316 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 
313 aa  263  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.67 
 
 
312 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0395145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2009  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.67 
 
 
312 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 
348 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.35 
 
 
312 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.18 
 
 
311 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.69 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.89 
 
 
340 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.76 
 
 
313 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.77 
 
 
321 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.57 
 
 
313 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  43.73 
 
 
313 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 
318 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.55 
 
 
311 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 
309 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.3 
 
 
318 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 
313 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.44 
 
 
321 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0439  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.79 
 
 
340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.94 
 
 
313 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.186347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.3 
 
 
318 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.37 
 
 
311 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.52 
 
 
343 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.52 
 
 
348 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.52 
 
 
348 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.3 
 
 
316 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.52 
 
 
348 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1288  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.52 
 
 
348 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.52 
 
 
348 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.52 
 
 
348 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2263  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.52 
 
 
348 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.77 
 
 
340 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152029  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.57 
 
 
318 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.17 
 
 
312 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.83 
 
 
315 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.38 
 
 
331 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.94 
 
 
313 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.73 
 
 
324 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.73 
 
 
326 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  43.71 
 
 
316 aa  256  5e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.54 
 
 
340 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000594661  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
319 aa  255  6e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  43.27 
 
 
319 aa  255  7e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>