More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1709 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  100 
 
 		 313 aa  627  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.31 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  53.45 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.34 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.03 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.72 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  31.49 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.34 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.79 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  30.07 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 		 292 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  30.56 
 
 		 336 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  33.52 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  39.76 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  27.65 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  30.73 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  33.73 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  32.52 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  33.55 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  32.52 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  32.52 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  25.95 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  32.7 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  30.6 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  33.95 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  33.95 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  27.78 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  29.88 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  30.39 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  33.13 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  33.33 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  33.73 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  29.28 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  27.07 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  34.36 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  32.72 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  33.95 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  32.69 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  28.31 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  27.96 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  34.44 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0495  UDP-glucose 4-epimerase  32.57 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  27.11 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.53 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  28.24 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  34.57 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  37.11 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  32.74 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  33.53 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  33.14 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  31.33 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  30.23 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  33.93 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  33.13 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  30.94 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  33.53 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  30.41 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  27.27 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  25.97 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  25.97 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  26.74 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>