More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1499 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 
293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.15 
 
 
321 aa  321  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.15 
 
 
322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  53.45 
 
 
313 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.17 
 
 
327 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
315 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.27 
 
 
279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
299 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
282 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.25 
 
 
292 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
301 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 
309 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
295 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
292 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
292 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  30.82 
 
 
297 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
290 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  31.6 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
295 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
290 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
305 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
279 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 
309 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
312 aa  99  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  31.23 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  27.27 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  33.54 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  28.08 
 
 
332 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  29.51 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  31.74 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  32.28 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.53 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  31.85 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  32.65 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  29.39 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  33.12 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  32.76 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  26.33 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  25.22 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  32.16 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  35.06 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  26.59 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  28.74 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  29.63 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  26.2 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  29.82 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  29.84 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  34.22 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  28.65 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  31.79 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  32.39 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  29.73 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  28.26 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  32.02 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>