More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5018 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
307 aa  628  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 
317 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
305 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
323 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
589 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
359 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
354 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
346 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
312 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
328 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
350 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  25.45 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.08 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  25.5 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  24.61 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.13 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  29.38 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 
368 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3576  UDP-glucuronate 5'-epimerase  30.5 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.3 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  25.38 
 
 
336 aa  62.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
372 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
299 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  25 
 
 
357 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  25.79 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 
388 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.46 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.62 
 
 
357 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
347 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  25.18 
 
 
302 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.39 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  29.69 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  31.4 
 
 
337 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
277 aa  58.9  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  24.92 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  35.42 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>