More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1230 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
295 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.55 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 
292 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.96 
 
 
290 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.33 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 
290 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.83 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  39.52 
 
 
299 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.14 
 
 
296 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  38.83 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 
298 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
297 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
297 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
302 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
305 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 
292 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.15 
 
 
299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
282 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
296 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 
309 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
302 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  31.79 
 
 
293 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
279 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  28.72 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
327 aa  108  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
315 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  28.16 
 
 
313 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  29 
 
 
299 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 
295 aa  99  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
268 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  29.32 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  32.73 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  28.8 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  28.27 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  25.35 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  29.53 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  27.37 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1520  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  28.57 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00376715  hitchhiker  3.69674e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  28.79 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.08 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  28.88 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  25.58 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  29.74 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  24.19 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  24.65 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
247 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  24.65 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  24.86 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  28.95 
 
 
336 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  26.61 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  24.32 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  26.42 
 
 
340 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  24.88 
 
 
338 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  25.94 
 
 
340 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  23.78 
 
 
340 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  26.61 
 
 
335 aa  62.4  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.45 
 
 
280 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  23.87 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
560 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  27.1 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  24.32 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  24.65 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  24.32 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>