More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0308 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
283 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.45 
 
 
292 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
279 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
279 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
302 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
282 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.92 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
301 aa  79  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  27.78 
 
 
299 aa  79  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  28.63 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  25.09 
 
 
313 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.54 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  28.8 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.43 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.6 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  26.78 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  35.29 
 
 
282 aa  72  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.54 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  28.66 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  25.54 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  33.72 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  30.27 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  31.35 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.61 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  30.06 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  33.72 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  30.41 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  23.53 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  30.06 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  29.24 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
560 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  31.93 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  25.95 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>