More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7512 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 
274 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.82 
 
 
261 aa  272  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.12 
 
 
267 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.81 
 
 
274 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.78 
 
 
274 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.65 
 
 
268 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
279 aa  208  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48 
 
 
273 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  45.15 
 
 
282 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  48.28 
 
 
267 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
268 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.49 
 
 
268 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
268 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.61 
 
 
261 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 
277 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.75 
 
 
267 aa  201  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.76 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  39.85 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.89 
 
 
274 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  39.85 
 
 
275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.24 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.7 
 
 
272 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  45.66 
 
 
270 aa  195  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.56 
 
 
269 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.15 
 
 
269 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
275 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.18 
 
 
280 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.42 
 
 
277 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.7 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.18 
 
 
277 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  46.27 
 
 
311 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
266 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.48 
 
 
273 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.69 
 
 
265 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.73 
 
 
278 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.22 
 
 
277 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.33 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  42.05 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.5 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.62 
 
 
273 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
278 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.23 
 
 
278 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.17 
 
 
279 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 
278 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 
244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.2 
 
 
272 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 
271 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
278 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.69 
 
 
275 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  37.69 
 
 
278 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  43.35 
 
 
255 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.4 
 
 
249 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.27 
 
 
247 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.12 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.19 
 
 
560 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.95 
 
 
276 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.51 
 
 
298 aa  135  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.68 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.25 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.4 
 
 
263 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
256 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
278 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
256 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
297 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511377  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.641211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02194  putative oxidoreductase protein  29.93 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415405  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.44 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  27.32 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>