More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3405 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
265 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.32 
 
 
266 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.2 
 
 
268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.42 
 
 
268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.42 
 
 
268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.03 
 
 
268 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.47 
 
 
267 aa  300  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.12 
 
 
272 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.29 
 
 
281 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.29 
 
 
281 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.04 
 
 
279 aa  291  7e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  54.26 
 
 
275 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.71 
 
 
275 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  54.51 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.49 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.69 
 
 
277 aa  282  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  53.1 
 
 
275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.75 
 
 
273 aa  281  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.52 
 
 
269 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.16 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.72 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.14 
 
 
277 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.94 
 
 
269 aa  271  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.95 
 
 
278 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.95 
 
 
278 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.24 
 
 
277 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.33 
 
 
278 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.33 
 
 
278 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.81 
 
 
278 aa  265  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  47.47 
 
 
280 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.26 
 
 
268 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  49.8 
 
 
311 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.79 
 
 
274 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  41.67 
 
 
255 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.66 
 
 
276 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.64 
 
 
267 aa  204  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.64 
 
 
279 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
273 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.19 
 
 
271 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  41.95 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.2 
 
 
261 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.6 
 
 
276 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.69 
 
 
273 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.53 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.25 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  42.29 
 
 
244 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.45 
 
 
295 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  40.33 
 
 
267 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.6 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.02 
 
 
275 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
278 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
277 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.2 
 
 
273 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.63 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
277 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.34 
 
 
252 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
560 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.19 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
247 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
278 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
252 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
249 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
290 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
255 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
302 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
299 aa  89.7  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1958  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
880 aa  72  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0262576  hitchhiker  0.00141398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.43 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.96 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>