More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3497 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  100 
 
 
275 aa  564  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
267 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.91 
 
 
280 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  45.53 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.19 
 
 
277 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
268 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.18 
 
 
268 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.92 
 
 
278 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.31 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.83 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.8 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.53 
 
 
278 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.53 
 
 
278 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.53 
 
 
278 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.63 
 
 
272 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.93 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.75 
 
 
278 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.63 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.02 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.7 
 
 
271 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 
275 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
279 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  41.63 
 
 
278 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  38.78 
 
 
275 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  38.78 
 
 
275 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.92 
 
 
266 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  40.38 
 
 
255 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  40.61 
 
 
282 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 
277 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 
279 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.46 
 
 
281 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 
269 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.46 
 
 
281 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 
265 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.02 
 
 
269 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.15 
 
 
261 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 
261 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 
267 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.69 
 
 
273 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.54 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  41.36 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 
276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
276 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  41.18 
 
 
311 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.33 
 
 
273 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
276 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  40.08 
 
 
267 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.15 
 
 
274 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.92 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.76 
 
 
270 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 
277 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.4 
 
 
272 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
278 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.63 
 
 
273 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.1 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.56 
 
 
263 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
560 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
249 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
255 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
247 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.07 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
257 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
290 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
320 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  31.79 
 
 
328 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  27.16 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
323 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
305 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.38 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
331 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
297 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>