More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19740 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.91 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.21 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.41 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.8 
 
 
298 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.86 
 
 
255 aa  162  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.21 
 
 
273 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 
560 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.62 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 
256 aa  152  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 
272 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.48 
 
 
267 aa  148  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  42.42 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.34 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.53 
 
 
257 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 
290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 
280 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  38.43 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.82 
 
 
278 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.82 
 
 
278 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 
244 aa  138  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.91 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
277 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.55 
 
 
282 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  34.85 
 
 
275 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.4 
 
 
273 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
278 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.69 
 
 
274 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.45 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  34.44 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  37.08 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  42.05 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
268 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
268 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
261 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
281 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
275 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
281 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.87 
 
 
268 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
277 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.56 
 
 
275 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
279 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.63 
 
 
269 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.25 
 
 
283 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
267 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  37.87 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 
272 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
278 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  34.2 
 
 
278 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
249 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
266 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
276 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
277 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
278 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  36.91 
 
 
311 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
295 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 
277 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
299 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.45 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.75 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
283 aa  92  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511377  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.641211 
 
 
-
 
NC_003296  RS02194  putative oxidoreductase protein  28.72 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415405  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
347 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  30.64 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  32.4 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>