More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02700 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 		 270 aa  532  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.69 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.36 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.97 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.98 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.87 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.78 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  44.19 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  40.78 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.98 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  38.11 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  40.15 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.23 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.03 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.55 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  36.33 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.33 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.62 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.08 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.5 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.32 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.45 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.91 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.52 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.42 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  37.45 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  41.5 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.76 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.08 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.06 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.06 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.2 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  41.33 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.92 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.78 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.66 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 560 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  34.36 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.1 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.41 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.63 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.29 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.47 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 		 283 aa  92.4  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  31.55 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02194  putative oxidoreductase protein  32.41 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.5 
 
 		 315 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  34.52 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  31.93 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  36.26 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.641211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>