More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1038 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1038  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1085    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00793798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.17 
 
 		 519 aa  474  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.06 
 
 		 503 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 		 507 aa  332  8e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1837  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.12 
 
 		 478 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00233436  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2207  hypothetical protein  27.86 
 
 		 339 aa  100  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.45 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.57 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.17 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 336 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  33.53 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  32.6 
 
 		 328 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.45 
 
 		 350 aa  62  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.79 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_5819  predicted protein  26.24 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.806455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.62 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.54 
 
 		 345 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.45 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.82 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  31.2 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  32.43 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.75 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.41 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.53 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5200  hypothetical protein  41.67 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.427177 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  31.03 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.73 
 
 		 348 aa  57  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.82 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00896  epimerase  31.54 
 
 		 635 aa  57  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 362 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  33.64 
 
 		 345 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3189  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 		 340 aa  57  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  32.43 
 
 		 336 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 326 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  33.64 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  27.37 
 
 		 328 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.06 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  22.75 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 		 315 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.08 
 
 		 338 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 358 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.84 
 
 		 322 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.95 
 
 		 366 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.94 
 
 		 350 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  27.13 
 
 		 328 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1928  hypothetical protein  45.16 
 
 		 329 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 		 333 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.92 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 		 321 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1585  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.89 
 
 		 653 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216403  normal  0.968528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 349 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 341 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 		 297 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 308 aa  54.3  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 328 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5739  hypothetical protein  47.37 
 
 		 277 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  25.52 
 
 		 356 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.82 
 
 		 635 aa  54.3  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.26 
 
 		 340 aa  54.3  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001772  UDP-glucose 4-epimerase  28.82 
 
 		 340 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 312 aa  54.3  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 		 306 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.19 
 
 		 346 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1600  hypothetical protein  25.26 
 
 		 326 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.03 
 
 		 345 aa  53.9  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.91 
 
 		 342 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.91 
 
 		 342 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.85 
 
 		 307 aa  53.9  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 331 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.61 
 
 		 332 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.19 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 322 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  22.78 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 320 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 320 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.77 
 
 		 340 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.46 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 336 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>