More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0020 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
353 aa  734    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.28 
 
 
344 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.77 
 
 
337 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.57 
 
 
343 aa  245  8e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.07 
 
 
330 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.41 
 
 
341 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.21 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.82 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.46 
 
 
335 aa  229  6e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.61 
 
 
355 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  37.76 
 
 
337 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.72 
 
 
341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.94 
 
 
335 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.56 
 
 
331 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.46 
 
 
325 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.35 
 
 
338 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.84 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  36.87 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  36.67 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.98 
 
 
327 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.13 
 
 
350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.73 
 
 
340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.31 
 
 
336 aa  212  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.17 
 
 
336 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.22 
 
 
340 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.63 
 
 
336 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.06 
 
 
345 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.04 
 
 
404 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  40.07 
 
 
328 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.44 
 
 
344 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.63 
 
 
350 aa  209  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.7 
 
 
327 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18620  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.61 
 
 
342 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436748  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.04 
 
 
326 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.96 
 
 
342 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.5 
 
 
332 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.83 
 
 
333 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  39.72 
 
 
328 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  42.12 
 
 
345 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.85 
 
 
329 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.2 
 
 
344 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.48 
 
 
333 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  41.18 
 
 
333 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.11 
 
 
356 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.49 
 
 
336 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.38 
 
 
680 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.17 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.47 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.82 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.68 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  37.62 
 
 
338 aa  200  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.63 
 
 
344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  38.75 
 
 
331 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.86 
 
 
345 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.14 
 
 
333 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.14 
 
 
333 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.12 
 
 
348 aa  199  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.19 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.48 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  40.48 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.08 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.08 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.45 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.97 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  38.41 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.59 
 
 
620 aa  197  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  37.25 
 
 
338 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  36.92 
 
 
331 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.75 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.6 
 
 
350 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.14 
 
 
331 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.06 
 
 
331 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.64 
 
 
350 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.06 
 
 
331 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  38.06 
 
 
334 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.79 
 
 
340 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  38.23 
 
 
332 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  37.72 
 
 
335 aa  193  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  38.06 
 
 
334 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.81 
 
 
614 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.24 
 
 
340 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  39.38 
 
 
333 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  37.37 
 
 
334 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4310  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.72 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.14 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  39.06 
 
 
328 aa  189  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.77 
 
 
607 aa  189  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.19 
 
 
635 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  38.62 
 
 
635 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.58 
 
 
332 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.13 
 
 
355 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.41 
 
 
333 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.14 
 
 
332 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.11 
 
 
332 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.09 
 
 
628 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0761  UDP-glucose 4-epimerase  37.46 
 
 
348 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  34.8 
 
 
332 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1878  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.45 
 
 
622 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822308  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.61 
 
 
676 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>