131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1837 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1837  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  100 
 
 		 478 aa  978    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.75 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1038  hypothetical protein  31.12 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00793798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 		 519 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 		 337 aa  86.7  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00233436  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2207  hypothetical protein  26.17 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 		 335 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  30.28 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 320 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 		 331 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 322 aa  53.9  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  29.5 
 
 		 306 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71224  Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating  26.15 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.12365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 		 328 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 308 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 327 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  34.46 
 
 		 340 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 		 324 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 307 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 		 339 aa  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 		 336 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.54 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.321568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 332 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 277 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 		 312 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.33 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.415706  decreased coverage  0.000106106 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.51 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 		 311 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  26.34 
 
 		 312 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 296 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 333 aa  48.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 342 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 321 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 680 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0904  hypothetical protein  30 
 
 		 318 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344615  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.05 
 
 		 366 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  28.74 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 349 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.36 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 328 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 		 352 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.35 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 309 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 355 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  26.6 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1956  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000864089  hitchhiker  0.00126231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  22.94 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.91 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  21.89 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.11 
 
 		 340 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 		 351 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 		 344 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  24.84 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  32.08 
 
 		 319 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 325 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381041 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  23.67 
 
 		 328 aa  44.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  23.98 
 
 		 319 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 324 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 323 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>