More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2216 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
328 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.321568  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.4 
 
 
334 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29880  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.12 
 
 
317 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
316 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
331 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  26.21 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0866778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3899  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  24.44 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
352 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169098 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.17 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.688029 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.33 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  29.03 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  29.5 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.62 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  29.22 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.74 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  24.69 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  30.14 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  26.04 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.88 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.415706  decreased coverage  0.000106106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  25.42 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  28.52 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  23.99 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  25.81 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423023  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  27 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.134819  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.4 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  25.94 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2712  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.19 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3118  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.34 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  21.4 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  24.8 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238348  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.39 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>