231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08520 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
503 aa  1043    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.36 
 
 
507 aa  588  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1837  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40.75 
 
 
478 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1038  hypothetical protein  37.06 
 
 
523 aa  347  3e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00793798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
519 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2207  hypothetical protein  31.17 
 
 
339 aa  111  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
337 aa  90.1  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00233436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.53 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.74 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  36.45 
 
 
337 aa  66.6  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  35.85 
 
 
344 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.79 
 
 
345 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.26 
 
 
336 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.04 
 
 
348 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.19 
 
 
350 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
320 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.94 
 
 
350 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  36.19 
 
 
345 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.33 
 
 
336 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.18 
 
 
327 aa  60.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.43 
 
 
345 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.29 
 
 
345 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18620  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.91 
 
 
342 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436748  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.13 
 
 
353 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
356 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.58 
 
 
335 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  32.41 
 
 
336 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.29 
 
 
346 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.29 
 
 
342 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.29 
 
 
342 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4310  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.38 
 
 
344 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.38 
 
 
348 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.63 
 
 
336 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.33 
 
 
350 aa  57.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.71 
 
 
340 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  31.43 
 
 
336 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.43 
 
 
338 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
296 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.28 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  28.22 
 
 
319 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  30.11 
 
 
329 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
321 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.38 
 
 
340 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  30 
 
 
329 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0761  UDP-glucose 4-epimerase  31.07 
 
 
348 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.57 
 
 
344 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.41 
 
 
350 aa  53.9  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.04 
 
 
329 aa  53.9  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.78 
 
 
332 aa  53.5  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
270 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  30.48 
 
 
279 aa  53.5  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
326 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5200  hypothetical protein  44.07 
 
 
202 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.427177 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.93 
 
 
332 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.48 
 
 
337 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.11 
 
 
341 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.27 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 
354 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
328 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  23.81 
 
 
328 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
339 aa  52.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.17 
 
 
376 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.52 
 
 
340 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.78 
 
 
340 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.38 
 
 
324 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
322 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  31.13 
 
 
329 aa  52  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.13 
 
 
325 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  28.3 
 
 
332 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02225  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07170)  32.46 
 
 
342 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.439161  normal  0.578499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1928  hypothetical protein  41.27 
 
 
329 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
315 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.53 
 
 
341 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.7 
 
 
327 aa  51.2  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.57 
 
 
344 aa  50.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
329 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.2 
 
 
342 aa  50.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
327 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.91 
 
 
333 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
337 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.85 
 
 
327 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
333 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  29.59 
 
 
333 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6190  hypothetical protein  34.04 
 
 
352 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0691552  hitchhiker  0.000300177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
328 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
329 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.41 
 
 
298 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
312 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  27.62 
 
 
328 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  28.75 
 
 
326 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.27 
 
 
337 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
317 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.21 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.21 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.28 
 
 
332 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
333 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
334 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
343 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>