More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1778 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
350 aa  724    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  64.56 
 
 
325 aa  425  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.98 
 
 
342 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  57.58 
 
 
329 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.14 
 
 
344 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  55.79 
 
 
333 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  57.27 
 
 
331 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  56.36 
 
 
328 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 
333 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  55.25 
 
 
327 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.63 
 
 
331 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.48 
 
 
327 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  56.36 
 
 
331 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.06 
 
 
333 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  57.01 
 
 
356 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.06 
 
 
331 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  58.07 
 
 
332 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.76 
 
 
332 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.94 
 
 
326 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.38 
 
 
357 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  54.71 
 
 
338 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  53.15 
 
 
334 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  53.15 
 
 
335 aa  370  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.15 
 
 
331 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.21 
 
 
331 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  53.15 
 
 
334 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.21 
 
 
331 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  55.35 
 
 
331 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  52.85 
 
 
334 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.23 
 
 
333 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.79 
 
 
333 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.79 
 
 
333 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.9 
 
 
331 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.22 
 
 
344 aa  362  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.55 
 
 
332 aa  361  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.52 
 
 
332 aa  361  9e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  53.85 
 
 
338 aa  361  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.94 
 
 
333 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.85 
 
 
332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  53.01 
 
 
332 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.46 
 
 
337 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.14 
 
 
333 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  53.14 
 
 
333 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  51.68 
 
 
339 aa  338  9e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2092  polysaccharide biosynthesis protein  49.85 
 
 
337 aa  332  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  48.48 
 
 
336 aa  322  6e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.11 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.62 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.86 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.94 
 
 
329 aa  271  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.29 
 
 
343 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.3 
 
 
340 aa  256  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.33 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.44 
 
 
335 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.99 
 
 
332 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.68 
 
 
330 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.21 
 
 
338 aa  242  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.49 
 
 
328 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.44 
 
 
341 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  44.06 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  44.21 
 
 
328 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18620  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  43.44 
 
 
342 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436748  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.32 
 
 
350 aa  236  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.39 
 
 
336 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.64 
 
 
336 aa  236  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4310  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.1 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  42.63 
 
 
337 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.47 
 
 
344 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.91 
 
 
341 aa  232  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  42.02 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.44 
 
 
340 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.51 
 
 
350 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.94 
 
 
344 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  45.61 
 
 
336 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  39.34 
 
 
344 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.21 
 
 
348 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.49 
 
 
355 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.52 
 
 
346 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.82 
 
 
350 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.68 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.93 
 
 
340 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.53 
 
 
335 aa  223  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.09 
 
 
345 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  45.23 
 
 
345 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.25 
 
 
336 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.08 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.97 
 
 
345 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.18 
 
 
341 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.94 
 
 
342 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.94 
 
 
342 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.08 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.13 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.02 
 
 
348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.01 
 
 
340 aa  212  9e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0761  UDP-glucose 4-epimerase  45.26 
 
 
348 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.46 
 
 
404 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.58 
 
 
680 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.18 
 
 
607 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  38.19 
 
 
649 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  39.86 
 
 
635 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>