More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0761 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0761  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 348 aa  713    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18620  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  68.14 
 
 		 342 aa  486  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  58.68 
 
 		 336 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  57.66 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.69 
 
 		 350 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  58.26 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.52 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  57.06 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  57.1 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.19 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.45 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.15 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.29 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.56 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.49 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.09 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.99 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.49 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  53.87 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.74 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.92 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.05 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  53.73 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4310  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.32 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.41 
 
 		 345 aa  371  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.25 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.59 
 
 		 346 aa  361  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.23 
 
 		 344 aa  358  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.7 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.09 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.77 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.71 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.81 
 
 		 325 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.31 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  44.01 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.42 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.69 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.51 
 
 		 332 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  42.71 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.52 
 
 		 355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  39.76 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.27 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.77 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2092  polysaccharide biosynthesis protein  39.53 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.39 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  38.51 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.34 
 
 		 355 aa  212  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  37.27 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.67 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.5 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.24 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.24 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.31 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.36 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.37 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  36.97 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.06 
 
 		 333 aa  209  8e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  40.91 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.15 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  38.89 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.55 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.76 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.89 
 
 		 335 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.2 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.09 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.84 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  40.49 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  39.87 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  40.28 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.81 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.32 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  36.73 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.97 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.82 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.72 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  39.46 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.72 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.25 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.65 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  37.8 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  37.39 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.88 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.59 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  37.95 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.02 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.24 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.75 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.28 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  37.28 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.45 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.74 
 
 		 357 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.51 
 
 		 331 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.23 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18500  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.42 
 
 		 626 aa  176  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.981447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3816  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.99 
 
 		 645 aa  175  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.02 
 
 		 404 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.58 
 
 		 647 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.51 
 
 		 635 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>