52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1584 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
519 aa  1075    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1038  hypothetical protein  46.17 
 
 
523 aa  474  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00793798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
503 aa  281  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
507 aa  273  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1837  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.98 
 
 
478 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2207  hypothetical protein  27.42 
 
 
339 aa  94  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00233436  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
355 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
355 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
355 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
337 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
356 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
356 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0026  hypothetical protein  40.62 
 
 
329 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1928  hypothetical protein  40.62 
 
 
329 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5200  hypothetical protein  38.24 
 
 
202 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.427177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
270 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
321 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
308 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
330 aa  52.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 
331 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.65 
 
 
336 aa  50.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
340 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6190  hypothetical protein  38.1 
 
 
352 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0691552  hitchhiker  0.000300177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.95 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  24.12 
 
 
328 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  25.73 
 
 
314 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  24.42 
 
 
328 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.82 
 
 
335 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5739  hypothetical protein  41.07 
 
 
277 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659091  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
328 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
328 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.7 
 
 
337 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.53 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.38 
 
 
341 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
319 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
309 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
333 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  24.82 
 
 
671 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
339 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
329 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
326 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
321 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
321 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.74 
 
 
323 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.19 
 
 
338 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.17 
 
 
335 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
317 aa  43.5  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  24.54 
 
 
326 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.92 
 
 
323 aa  43.5  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>