More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1557 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
340 aa  680    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.54 
 
 
330 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.58 
 
 
331 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52 
 
 
328 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52 
 
 
328 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52 
 
 
328 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.67 
 
 
332 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 
357 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
589 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.52 
 
 
349 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.22 
 
 
354 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
320 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  30.1 
 
 
318 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
347 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
338 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
349 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
351 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
349 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.04 
 
 
365 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
466 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
466 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
466 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
372 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
347 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 
350 aa  89.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
680 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.04 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  29.48 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
304 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  28.77 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  27.33 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  27.34 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  30.93 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  30.93 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.49 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  35.94 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.07 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
358 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
368 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  28.08 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  32.79 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  27.88 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  26.27 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
268 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
345 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  26.64 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>