More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4590 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.39 
 
 		 328 aa  651    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 328 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 328 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.18 
 
 		 330 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.36 
 
 		 331 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 		 332 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 589 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.86 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 		 466 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 		 466 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 		 466 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.03 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.01 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.04 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  31.31 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.64 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 		 358 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 372 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  24.4 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  23.8 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  27.95 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  28.92 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 680 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.29 
 
 		 508 aa  72.4  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  29.82 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.52 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  26.24 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.19 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2411  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.52 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.261098 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.65 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  26.49 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  25.2 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  27.05 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  28 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  28 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  22.89 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  25.94 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.71 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>