More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0058 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
337 aa  692    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00233436  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
355 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
355 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
356 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2207  hypothetical protein  26.81 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
507 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1038  hypothetical protein  27.76 
 
 
523 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00793798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
503 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1837  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.69 
 
 
478 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 
519 aa  85.9  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  31.36 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  31.16 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  28.77 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  29.68 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  29.22 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0495  UDP-glucose 4-epimerase  30.64 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  29.22 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  29.22 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  31.43 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  29.68 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  27.98 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  29.22 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  27.96 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  29.22 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  29.22 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  28.77 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  28.77 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  28.37 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  28.77 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  28.24 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  32.34 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
510 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  27.98 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.31 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
270 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  29.91 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  30.32 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  31.52 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  30.32 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.17 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  28.24 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  27.31 
 
 
351 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  27.01 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  30.09 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  33.53 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.67 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  27.19 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0734  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.47 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.290638  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.34 
 
 
375 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  29.55 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
276 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
278 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  29.26 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  29.83 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  27.65 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.18 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  26.73 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>