13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6190 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6190  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  716    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0691552  hitchhiker  0.000300177 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6758  hypothetical protein  44.41 
 
 		 345 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3114  hypothetical protein  42.5 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7330  hypothetical protein  40.06 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0725371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1928  hypothetical protein  32.36 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5739  hypothetical protein  38.25 
 
 		 277 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0026  hypothetical protein  32.07 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5200  hypothetical protein  42.06 
 
 		 202 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.427177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6318  hypothetical protein  25.49 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1038  hypothetical protein  45 
 
 		 523 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00793798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 503 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 519 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1837  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  44.64 
 
 		 478 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>