More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0501 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
330 aa  667    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  65.14 
 
 
343 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  58.41 
 
 
344 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.09 
 
 
340 aa  330  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50 
 
 
332 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.2 
 
 
341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.48 
 
 
335 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.51 
 
 
337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.34 
 
 
341 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.92 
 
 
404 aa  292  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.05 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.67 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.65 
 
 
329 aa  275  9e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  47.55 
 
 
328 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.85 
 
 
328 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.95 
 
 
335 aa  264  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  46.5 
 
 
328 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44 
 
 
613 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  44.62 
 
 
332 aa  252  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.68 
 
 
350 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  45.36 
 
 
335 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.67 
 
 
333 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.67 
 
 
333 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.55 
 
 
325 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.69 
 
 
338 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.53 
 
 
680 aa  245  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  43.64 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.07 
 
 
353 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.3 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.85 
 
 
344 aa  242  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.18 
 
 
342 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.82 
 
 
332 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.65 
 
 
332 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.79 
 
 
327 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.36 
 
 
607 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.33 
 
 
332 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 
336 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  47.24 
 
 
647 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.74 
 
 
646 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.75 
 
 
614 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  43.99 
 
 
334 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.18 
 
 
638 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  42.61 
 
 
331 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.61 
 
 
331 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  41.69 
 
 
336 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  42.96 
 
 
332 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  43.64 
 
 
334 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  38.67 
 
 
344 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  47.66 
 
 
614 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.18 
 
 
613 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.64 
 
 
331 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.64 
 
 
331 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  43.64 
 
 
334 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  40.78 
 
 
337 aa  235  7e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  42.47 
 
 
338 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.32 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.25 
 
 
647 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  42.27 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.71 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.27 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  42.96 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.27 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.7 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.46 
 
 
342 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.46 
 
 
342 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  42.6 
 
 
336 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.76 
 
 
344 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.92 
 
 
333 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  43.89 
 
 
649 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.88 
 
 
350 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.75 
 
 
340 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  42.27 
 
 
331 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.03 
 
 
327 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.45 
 
 
620 aa  231  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.3 
 
 
340 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.23 
 
 
331 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.09 
 
 
656 aa  230  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.08 
 
 
650 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.18 
 
 
628 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  42.27 
 
 
331 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2627  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.85 
 
 
628 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.79 
 
 
336 aa  230  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.18 
 
 
340 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.38 
 
 
635 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.69 
 
 
612 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  45.17 
 
 
635 aa  229  7e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.37 
 
 
612 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.88 
 
 
345 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  46.95 
 
 
604 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.06 
 
 
341 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  42.12 
 
 
356 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.28 
 
 
647 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.95 
 
 
617 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.72 
 
 
653 aa  226  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  41.16 
 
 
338 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.32 
 
 
340 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.01 
 
 
350 aa  226  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.56 
 
 
333 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.55 
 
 
607 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.54 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>