More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13505 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13505  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  100 
 
 
364 aa  736    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.46 
 
 
326 aa  332  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.69 
 
 
327 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.047646  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.04 
 
 
334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.84 
 
 
343 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.68 
 
 
327 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.36 
 
 
323 aa  235  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.58 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0595  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
297 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
273 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0181663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
289 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.950966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
297 aa  143  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.838406  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4287  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.06 
 
 
297 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
303 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.94 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.6 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  25.16 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.32 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
384 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  26.95 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  33.91 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.69 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.13 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  36.77 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  25.55 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.08 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  25.3 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  25.3 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  34.74 
 
 
322 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
316 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.71 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.43 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.07 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0337048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  30.81 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210493  normal  0.642206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 
308 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.18 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  26.23 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.72 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.69 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.18 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  29.67 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.98 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6490  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.82 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03949  NAD(P)H steroid dehydrogenase  36.59 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.45 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.74 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.74 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  31.77 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>