67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2166 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
338 aa  666    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.91 
 
 
327 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  47.04 
 
 
330 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  45.6 
 
 
330 aa  242  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 
333 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.84 
 
 
330 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
346 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 
337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.25 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  28.84 
 
 
345 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  29.5 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  29.5 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  29.5 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  29.47 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  28.84 
 
 
340 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  29.15 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  28.84 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
345 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.97 
 
 
316 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.34 
 
 
328 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  32.73 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.47 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.26 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
352 aa  105  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
341 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
327 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
335 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
328 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
328 aa  62.8  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  31.06 
 
 
304 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.45 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  29.8 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.07 
 
 
310 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  21.63 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  21.63 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 
350 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  21.05 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  27.87 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  24.58 
 
 
341 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  20.98 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.67 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
326 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
304 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>