153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3358 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  100 
 
 
330 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  67.72 
 
 
330 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.6 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.3 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.16 
 
 
333 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.01 
 
 
324 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.04 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  40.79 
 
 
331 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 
330 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.45 
 
 
327 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.58 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.46 
 
 
331 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  29.36 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  29.12 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  29.84 
 
 
341 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  32.25 
 
 
345 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  28.28 
 
 
341 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  28.28 
 
 
340 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  28.28 
 
 
340 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  28.28 
 
 
340 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
345 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
342 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  33.82 
 
 
324 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.76 
 
 
328 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
335 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.68 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  22.09 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  22.31 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  21.69 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 
311 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.51 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.51 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.31 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  30.96 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  26.4 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  33.06 
 
 
313 aa  53.1  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  22.98 
 
 
290 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.54 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.73 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.51 
 
 
376 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  22.58 
 
 
292 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.5 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  22.58 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  22.18 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  19.76 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  22.77 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.85 
 
 
361 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  20.63 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  22.89 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.21 
 
 
330 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
302 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.36 
 
 
375 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.26 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
411 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.98 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2712  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.17 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.65 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.61 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.79 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  28.39 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  29.37 
 
 
351 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0754  hypothetical protein  27.67 
 
 
205 aa  47.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.97 
 
 
375 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
335 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  28.57 
 
 
304 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.34 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  26.47 
 
 
319 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
298 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1448  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.22 
 
 
213 aa  46.6  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000730135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.61 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  29.28 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  25.66 
 
 
724 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.27 
 
 
310 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>