54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1448 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1448  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000730135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0237  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.84 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.545731 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0754  hypothetical protein  26.01 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 		 334 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0457  C factor cell-cell signaling protein  33.33 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 294 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0466  C factor cell-cell signaling protein  32.05 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0440  C factor cell-cell signaling protein  32.05 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3873  C factor cell-cell signaling protein  32.05 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 		 309 aa  48.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 		 296 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7089  domain of unknown function DUF1731  26.15 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299999  normal  0.928503 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01860  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0285542  normal  0.653902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  27.22 
 
 		 330 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 306 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 		 286 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0523  C factor cell-cell signaling protein  30.77 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 298 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 307 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 307 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 315 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0360339 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  24.39 
 
 		 336 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.7 
 
 		 297 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  23.73 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.73 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 		 346 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.388725 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.73 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0593  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.73 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.73 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.73 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  27.21 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  23.71 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 322 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.38 
 
 		 308 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 300 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022517 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45515  predicted protein  25.16 
 
 		 314 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219674  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 466 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 466 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 		 321 aa  42  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 		 298 aa  41.6  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 466 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.33 
 
 		 335 aa  41.2  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  28.46 
 
 		 304 aa  41.6  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000290359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>