213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2527 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
412 aa  805    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.5 
 
 
424 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2076  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.35 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 
430 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
431 aa  200  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 
429 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.9 
 
 
431 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181526  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0265  hypothetical protein  30.66 
 
 
440 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  28.32 
 
 
432 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  27.75 
 
 
432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.82 
 
 
194 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
450 aa  98.2  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 
300 aa  91.3  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.022517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1933  hypothetical protein  31.08 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497125  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3296  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.82 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.587332  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.245383 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  22.8 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0754  hypothetical protein  28.03 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.07 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  23.04 
 
 
316 aa  63.5  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  23.08 
 
 
302 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
439 aa  61.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
295 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
326 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  30.05 
 
 
328 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
295 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  24.9 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  27.88 
 
 
328 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.51 
 
 
327 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  26.46 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  26.46 
 
 
334 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
328 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04340  hypothetical protein  34.84 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.75 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  32.44 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.2 
 
 
328 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
218 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.545731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.57 
 
 
326 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
307 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
318 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1706  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.04 
 
 
309 aa  57  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  26.28 
 
 
320 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.27 
 
 
297 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
305 aa  56.6  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
307 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.42 
 
 
389 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
320 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  31.42 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3645  domain of unknown function DUF1731  46.25 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3788  putative transmembrane oxidoreductase protein  24.68 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754913  normal  0.999241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
307 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0425  hypothetical protein  34.19 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
211 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
306 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3719  domain of unknown function DUF1731  46.25 
 
 
298 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.488792  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.48 
 
 
320 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  29.33 
 
 
327 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  26.41 
 
 
340 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
211 aa  53.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 
312 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.33 
 
 
320 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.38 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
302 aa  53.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
314 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0660  dehydrogenase  27.27 
 
 
321 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  28.16 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  24.09 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  26.35 
 
 
306 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  24.11 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  27.23 
 
 
510 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
318 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  38.46 
 
 
312 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  28.16 
 
 
328 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  22.93 
 
 
320 aa  50.4  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.59 
 
 
336 aa  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
304 aa  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  40 
 
 
310 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  27.41 
 
 
334 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  30.72 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0593  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>