More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1265 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  876    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  98.38 
 
 
432 aa  863    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
417 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
431 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
417 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
439 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 
435 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
440 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
440 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
440 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1933  hypothetical protein  33.33 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497125  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
430 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
430 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.022517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
289 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
305 aa  150  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.245383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
286 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0425  hypothetical protein  28.05 
 
 
423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04340  hypothetical protein  27.82 
 
 
423 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
412 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
431 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181526  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2076  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.53 
 
 
442 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0265  hypothetical protein  23.57 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
301 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  26.19 
 
 
340 aa  97.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
194 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  23.59 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
296 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 
291 aa  89  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
309 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  27.11 
 
 
320 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 
308 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
309 aa  86.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
326 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
298 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  23.7 
 
 
297 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  28.06 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
318 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
318 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3296  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.95 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.587332  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
318 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  25.41 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 
309 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  24.75 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
295 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  24.91 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  23.97 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.42 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  25.09 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  23.59 
 
 
302 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  24.75 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  25.17 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4953  NADH dehydrogenase  22.99 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  25.78 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  25.59 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.04 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  28.28 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  28.24 
 
 
317 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  28.24 
 
 
317 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.665439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.47 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.79 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  29.64 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  25.87 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  24.67 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  24.33 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  25.17 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.28 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>