More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7062 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  100 
 
 		 512 aa  1012    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.78 
 
 		 510 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6237  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.45 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00211622  normal  0.83215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  66.03 
 
 		 498 aa  547  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3532  NmrA family protein  61.97 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1356  NmrA family protein  60.16 
 
 		 563 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.055285  hitchhiker  0.0000216517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3487  NmrA family protein  61.01 
 
 		 498 aa  535  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04460  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  59.52 
 
 		 503 aa  523  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.873482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.1 
 
 		 528 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1242  NmrA family protein  55.47 
 
 		 498 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1297  NmrA family protein  55.8 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000203122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5626  hypothetical protein  62.03 
 
 		 515 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  53.8 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  58.63 
 
 		 510 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.08 
 
 		 573 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21160  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.19 
 
 		 561 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.12 
 
 		 530 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  45.77 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  46.46 
 
 		 605 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  47.81 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  46.03 
 
 		 513 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.07 
 
 		 512 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0236  hypothetical protein  46.54 
 
 		 538 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.06 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3337  hypothetical protein  49.49 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.246336  normal  0.84548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  38.08 
 
 		 470 aa  352  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05895  hypothetical protein  38.54 
 
 		 473 aa  345  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01040  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  44.12 
 
 		 465 aa  340  5e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.5 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.37 
 
 		 325 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 		 327 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1726  hypothetical protein  40.17 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.02 
 
 		 325 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.02 
 
 		 325 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.02 
 
 		 325 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.42 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.17 
 
 		 301 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.91 
 
 		 479 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2621  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.45 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1587  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.45 
 
 		 496 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.81 
 
 		 305 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.67 
 
 		 325 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.95 
 
 		 326 aa  261  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 478 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.577692  normal  0.772598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  47.14 
 
 		 311 aa  258  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 478 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 		 478 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.17 
 
 		 476 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 		 476 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.17 
 
 		 476 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.17 
 
 		 476 aa  246  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.17 
 
 		 476 aa  246  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  34.17 
 
 		 476 aa  246  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  34.17 
 
 		 476 aa  246  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  49.67 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.96 
 
 		 476 aa  243  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.3 
 
 		 296 aa  243  7.999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.88 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.09 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003773  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.6 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.88 
 
 		 477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 478 aa  240  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.12 
 
 		 310 aa  240  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02651  hypothetical protein  32.86 
 
 		 481 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.68 
 
 		 477 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.61 
 
 		 477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 		 459 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.28 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 		 318 aa  230  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.26 
 
 		 327 aa  229  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.75 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1238  hypothetical protein  32.04 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0298417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 311 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 		 298 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.65 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.95 
 
 		 382 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 		 491 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.7 
 
 		 300 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00493208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.21 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273569  normal  0.188278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.82 
 
 		 355 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0987842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.01 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  35.08 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3124  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.86 
 
 		 335 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.39 
 
 		 335 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.837895  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.73 
 
 		 335 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5277  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.26 
 
 		 312 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 296 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 294 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  28.32 
 
 		 302 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 		 308 aa  92.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 309 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>