More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4134 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 358 aa  704    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.78 
 
 		 378 aa  345  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273569  normal  0.188278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.39 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.39 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.39 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.92 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3487  NmrA family protein  42.94 
 
 		 498 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.18 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1356  NmrA family protein  41.55 
 
 		 563 aa  195  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.055285  hitchhiker  0.0000216517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6237  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.81 
 
 		 505 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00211622  normal  0.83215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04460  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  44.28 
 
 		 503 aa  190  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.873482  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.07 
 
 		 510 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  44.29 
 
 		 506 aa  189  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  41.07 
 
 		 512 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21160  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.05 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3532  NmrA family protein  41.3 
 
 		 513 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  40.34 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5626  hypothetical protein  43.34 
 
 		 515 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.23 
 
 		 528 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.69 
 
 		 491 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01040  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.95 
 
 		 465 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1242  NmrA family protein  39.35 
 
 		 498 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 		 573 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1297  NmrA family protein  37.87 
 
 		 511 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000203122 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  42.43 
 
 		 311 aa  173  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  38.98 
 
 		 605 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 		 530 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3337  hypothetical protein  38.13 
 
 		 491 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.246336  normal  0.84548 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  37.07 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  42.35 
 
 		 498 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.86 
 
 		 296 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0236  hypothetical protein  38.59 
 
 		 538 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 		 482 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 		 512 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  33.99 
 
 		 513 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  30.63 
 
 		 470 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05895  hypothetical protein  31.21 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.46 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 479 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.14 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  35.99 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 496 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2621  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30 
 
 		 496 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1587  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30 
 
 		 496 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1726  hypothetical protein  32.85 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 		 478 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00493208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003773  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.17 
 
 		 492 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.21 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.21 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.21 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.21 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  30.21 
 
 		 476 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  30.21 
 
 		 476 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0987842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1238  hypothetical protein  31.04 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0298417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.86 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.77 
 
 		 504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02651  hypothetical protein  28.22 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.837895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 		 478 aa  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.577692  normal  0.772598 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.56 
 
 		 477 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.31 
 
 		 477 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.97 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.31 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3124  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.05 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198985  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.31 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  30.69 
 
 		 514 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 506 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 478 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 299 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 		 489 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 491 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5277  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.26 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.55 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  28.04 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>