More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0008 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
311 aa  621  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  60.07 
 
 
311 aa  341  8e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.32 
 
 
296 aa  340  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.69 
 
 
301 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.34 
 
 
305 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.73 
 
 
325 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  47.57 
 
 
513 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.33 
 
 
310 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  42.86 
 
 
470 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.32 
 
 
310 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  51.85 
 
 
305 aa  255  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.21 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  46.58 
 
 
506 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.81 
 
 
313 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 
474 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.93 
 
 
530 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.58 
 
 
327 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.3 
 
 
318 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05895  hypothetical protein  41.16 
 
 
473 aa  235  7e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  44.9 
 
 
605 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 
512 aa  232  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.86 
 
 
459 aa  232  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0236  hypothetical protein  44.62 
 
 
538 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1726  hypothetical protein  39.61 
 
 
482 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  45.83 
 
 
513 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.58 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  47.42 
 
 
510 aa  222  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.37 
 
 
482 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  42.86 
 
 
512 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.74 
 
 
573 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6237  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.49 
 
 
505 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00211622  normal  0.83215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.12 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3487  NmrA family protein  43.34 
 
 
498 aa  212  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19435  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  45.72 
 
 
498 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1356  NmrA family protein  46.83 
 
 
563 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.055285  hitchhiker  0.0000216517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 
325 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 
325 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01040  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  42.53 
 
 
465 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 
325 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.69 
 
 
325 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5626  hypothetical protein  47.35 
 
 
515 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.52 
 
 
510 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04460  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  45.23 
 
 
503 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.873482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.1 
 
 
299 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3532  NmrA family protein  40.85 
 
 
513 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3337  hypothetical protein  42.62 
 
 
491 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.246336  normal  0.84548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.88 
 
 
476 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
476 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.39 
 
 
300 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00493208  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.22 
 
 
476 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.22 
 
 
476 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.22 
 
 
476 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
476 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  34.22 
 
 
476 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.22 
 
 
476 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  34.22 
 
 
476 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
528 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1242  NmrA family protein  35.87 
 
 
498 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1297  NmrA family protein  37.95 
 
 
511 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000203122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 
478 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 
358 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.54 
 
 
335 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40.45 
 
 
504 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.54 
 
 
335 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.837895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.52 
 
 
491 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3124  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.73 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.41 
 
 
355 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0987842  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.89 
 
 
477 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
479 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.55 
 
 
477 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.89 
 
 
477 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.55 
 
 
477 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
489 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.55 
 
 
477 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.38 
 
 
326 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02651  hypothetical protein  31.79 
 
 
481 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  30.56 
 
 
514 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2621  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.45 
 
 
496 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
496 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1587  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.45 
 
 
496 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
478 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
478 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.577692  normal  0.772598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003773  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.36 
 
 
492 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1238  hypothetical protein  33.77 
 
 
478 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0298417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 
382 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 
382 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 
382 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21160  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.85 
 
 
561 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.55 
 
 
378 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273569  normal  0.188278 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.37 
 
 
382 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 
506 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
491 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5277  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
298 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
295 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
295 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
294 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
306 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>