More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0354 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 310 aa  627  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.16 
 
 		 310 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  71.04 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.33 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.21 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.8 
 
 		 325 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.13 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.98 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  54.27 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  52.86 
 
 		 506 aa  288  9e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  49.2 
 
 		 513 aa  277  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.33 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  48.86 
 
 		 513 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.08 
 
 		 530 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.17 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.74 
 
 		 512 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0236  hypothetical protein  48.71 
 
 		 538 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  47.17 
 
 		 605 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.41 
 
 		 459 aa  254  9e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  45.97 
 
 		 512 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6237  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.39 
 
 		 505 aa  245  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00211622  normal  0.83215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.74 
 
 		 313 aa  245  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.85 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.85 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.85 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  48.68 
 
 		 498 aa  238  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05895  hypothetical protein  38.38 
 
 		 473 aa  237  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.19 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3487  NmrA family protein  46.33 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 		 510 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.24 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.41 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04460  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.35 
 
 		 503 aa  230  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.873482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  51.42 
 
 		 510 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  38.26 
 
 		 470 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1356  NmrA family protein  45.21 
 
 		 563 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.055285  hitchhiker  0.0000216517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3532  NmrA family protein  44.22 
 
 		 513 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.81 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1726  hypothetical protein  40.13 
 
 		 482 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.24 
 
 		 573 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5626  hypothetical protein  46.15 
 
 		 515 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.09 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.26 
 
 		 491 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01040  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.25 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.21 
 
 		 528 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1242  NmrA family protein  42.16 
 
 		 498 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3337  hypothetical protein  43.18 
 
 		 491 aa  198  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.246336  normal  0.84548 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.39 
 
 		 504 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.27 
 
 		 478 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.46 
 
 		 478 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1297  NmrA family protein  39.68 
 
 		 511 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000203122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.19 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00493208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.24 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.91 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.91 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.91 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 		 478 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.57 
 
 		 477 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.23 
 
 		 476 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.23 
 
 		 476 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 		 489 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0987842  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 476 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.89 
 
 		 476 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.89 
 
 		 476 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.89 
 
 		 476 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 476 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.89 
 
 		 476 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.24 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  33.89 
 
 		 476 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3124  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.59 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  31.76 
 
 		 514 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2621  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.56 
 
 		 496 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.837895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 		 496 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 		 506 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1587  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.56 
 
 		 496 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02651  hypothetical protein  32.99 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21160  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.71 
 
 		 561 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1238  hypothetical protein  32.21 
 
 		 478 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0298417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003773  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.89 
 
 		 492 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.31 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 		 478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.577692  normal  0.772598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 		 491 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 		 358 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 		 378 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273569  normal  0.188278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5277  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 		 291 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>