More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0425 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0425  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  794    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04340  hypothetical protein  92.67 
 
 
423 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.41 
 
 
439 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
450 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1933  hypothetical protein  38.06 
 
 
423 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497125  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
430 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
417 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  28.28 
 
 
432 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
417 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
435 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  27.59 
 
 
432 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
440 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
440 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
440 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
429 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 
286 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 
429 aa  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 
300 aa  107  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.022517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
431 aa  100  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
289 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0265  hypothetical protein  29.16 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
305 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.245383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
298 aa  93.6  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
295 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  27.49 
 
 
302 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
302 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
306 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
295 aa  87  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
326 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
294 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181526  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
298 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
294 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2076  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.9 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  27.74 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.17 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.64 
 
 
329 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.16 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  34.62 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.63 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  27.92 
 
 
294 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.074322  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1049  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.41 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  29.63 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  27.49 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  29.22 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.32 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.98 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02430  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 
375 aa  67  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000237678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
299 aa  67  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
309 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
309 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.42 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.23 
 
 
316 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  25 
 
 
327 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
311 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
305 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  28.93 
 
 
512 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.48 
 
 
332 aa  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
301 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  30.89 
 
 
334 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
323 aa  63.2  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  30.89 
 
 
334 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
353 aa  63.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
314 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  24.45 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  25.6 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
296 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0660  dehydrogenase  27.19 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  29.08 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
305 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
305 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  25.11 
 
 
317 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0343  NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.28 
 
 
325 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00306764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
321 aa  59.7  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0173  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.63 
 
 
321 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  26.62 
 
 
323 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>