More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2202 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
286 aa  586  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
295 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  33.11 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
450 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  33.11 
 
 
432 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
294 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1933  hypothetical protein  37.59 
 
 
423 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497125  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
439 aa  143  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.022517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.37 
 
 
297 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 
289 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
306 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
435 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 
417 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
429 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
294 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
431 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
440 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
440 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
440 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
309 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
430 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
303 aa  122  9e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  28 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
291 aa  118  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
298 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
306 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
299 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
308 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.245383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 
381 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
429 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
302 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
326 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
318 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  25.09 
 
 
302 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
430 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  27.12 
 
 
316 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
321 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
309 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.74 
 
 
316 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  26.69 
 
 
340 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 
296 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.15 
 
 
326 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.73 
 
 
328 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
323 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  31.78 
 
 
327 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0343  NADH-ubiquinone oxidoreductase  30.26 
 
 
325 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00306764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4953  NADH dehydrogenase  33.7 
 
 
318 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.45 
 
 
389 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29 
 
 
335 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  30.36 
 
 
328 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
349 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.62 
 
 
321 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  29.39 
 
 
328 aa  99.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0425  hypothetical protein  32.88 
 
 
423 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  28.7 
 
 
338 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
338 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
321 aa  99.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  27.91 
 
 
336 aa  99.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  29.39 
 
 
328 aa  99  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
312 aa  99  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 
318 aa  99  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  28.8 
 
 
328 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.32 
 
 
329 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
328 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0660  dehydrogenase  32.6 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.02 
 
 
431 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181526  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2240  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.22 
 
 
381 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167528  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  33.97 
 
 
389 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
512 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.074322  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  30.84 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26150  predicted protein  24.69 
 
 
366 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0173  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.28 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04340  hypothetical protein  30.8 
 
 
423 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1049  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.39 
 
 
412 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
194 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  30.07 
 
 
389 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
321 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
319 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  26.1 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 
424 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
353 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
412 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  23.6 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  27.02 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>