More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0199 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.73 
 
 
440 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  85.34 
 
 
417 aa  690    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
435 aa  854    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.73 
 
 
440 aa  720    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.73 
 
 
440 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.38 
 
 
417 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.69 
 
 
430 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.56 
 
 
450 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.41 
 
 
439 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1933  hypothetical protein  43.59 
 
 
423 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497125  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  31.76 
 
 
432 aa  223  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  31.76 
 
 
432 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.48 
 
 
300 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.022517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.15 
 
 
431 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.55 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.245383 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
430 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
286 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0425  hypothetical protein  33.26 
 
 
423 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04340  hypothetical protein  31.93 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
291 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
295 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  30.51 
 
 
297 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
309 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
295 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
294 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
308 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
299 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
306 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
287 aa  99.8  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0593  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
316 aa  99  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
424 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
294 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0265  hypothetical protein  29.61 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
318 aa  97.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
298 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
305 aa  93.2  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
306 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
312 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
431 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181526  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
318 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
296 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
302 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
294 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.32 
 
 
335 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
320 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  30.27 
 
 
334 aa  86.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
318 aa  86.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.89 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.837895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.1 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2076  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.05 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  30.84 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3124  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.32 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198985  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  27.08 
 
 
328 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  31.25 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
308 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.440205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  31.85 
 
 
294 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  27.08 
 
 
328 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  28.94 
 
 
311 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.52 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.06 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0332  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.82 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171865  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.63 
 
 
194 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
298 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  25.94 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.87 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
319 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
319 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
319 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  29.18 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  28.83 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  32.73 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.15 
 
 
389 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
325 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  26.58 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.72 
 
 
328 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>