More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2016 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  100 
 
 
339 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  76.53 
 
 
323 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  76.53 
 
 
323 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  69.33 
 
 
332 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  69.77 
 
 
328 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  61.77 
 
 
327 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  64.62 
 
 
325 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  57.37 
 
 
320 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  51.85 
 
 
320 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  51.23 
 
 
320 aa  349  3e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  50 
 
 
320 aa  344  1e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  48.15 
 
 
320 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  49.38 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  47.98 
 
 
324 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  47.66 
 
 
324 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  47.84 
 
 
320 aa  329  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  48.15 
 
 
320 aa  328  6e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  47.22 
 
 
320 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  50.81 
 
 
314 aa  317  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  35.22 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.55 
 
 
291 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  26.3 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26.58 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  25.47 
 
 
297 aa  96.3  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  31.06 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  28.99 
 
 
291 aa  92.8  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  36.77 
 
 
288 aa  89.4  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  40.88 
 
 
216 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.17 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  30.58 
 
 
290 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
309 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  29.61 
 
 
289 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  36.67 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  28.82 
 
 
293 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
308 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  32.16 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  31.25 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  26.32 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  27.71 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  31.4 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  33 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  33 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  23.68 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  28.81 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1032  NmrA family protein  28.05 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  24.01 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.79 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
214 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.81 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  30.41 
 
 
290 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.23 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  29.27 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  31.36 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  24.22 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  27.82 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3092  NmrA-like protein  29.39 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  30.1 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  28.22 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  24.18 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.28 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  29.57 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  28.21 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  29.61 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  25.5 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.49 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  24.13 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  23.2 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  32.93 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  31.79 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  25.64 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  23.4 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.57 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.61 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  36.52 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  27.1 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  24.83 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.47 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  31.29 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  29.55 
 
 
292 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  27.11 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  27.22 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  26.75 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>