More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1311 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.545731 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01860  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 287 aa  95.9  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0285542  normal  0.653902 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0237  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.43 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50236  predicted protein  28.72 
 
 		 267 aa  85.9  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.65 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1933  hypothetical protein  36.36 
 
 		 423 aa  72  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497125  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.9 
 
 		 336 aa  72  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30.81 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  31.06 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.77 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.4 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  31.49 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1448  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.45 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000730135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 294 aa  61.6  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  33.71 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 431 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  29.69 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 424 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.05 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  34.25 
 
 		 320 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.66 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  29.65 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  28.57 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  23.53 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  23.53 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  23.53 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  23.53 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 349 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  27.37 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 321 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  23.53 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  28.95 
 
 		 311 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  24.4 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  27.57 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 342 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34681  predicted protein  27.7 
 
 		 329 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0414055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  23.53 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  23.53 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.44 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  31.36 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  31.36 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 315 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 		 326 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 429 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  31.36 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1128  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase/reductase  25.79 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29 
 
 		 329 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 		 440 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  28.96 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 320 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 306 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 		 440 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 		 440 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  24.75 
 
 		 320 aa  52.4  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  36.61 
 
 		 320 aa  52.4  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 		 321 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.83 
 
 		 321 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 307 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>